物語は、宇宙とカオスの2つの神を中心に展開しています。
神と彼らのチャンピオン以外に、プレーヤーはマニキンと呼ばれるクリスタルのようなドッペルゲンガーも扱っています。
ストーリー「 Final Dissidia for Fantasy 」は、ハーモニーの女神であるコスモスと、不和の神であるカオスという2つの神々を中心に展開しています。
このゲームには、すべてのキャラクターを通してプレイする必要がある包括的なストーリーラインがあります。
ゲームには、22の合計プレイ可能なキャラクターが含まれています:10人のヒーローと10人の悪役、
ファイナルファンタXを通じてファイナルファンタを代表するそれぞれの1つ、
そして2つの秘密のキャラクター:ファイナルファンタXIを代表するヒロイン、
そして、ファンタルXIIの決勝を代表する悪役。当初、すべてのゲームプレイモードでプレイ可能な10人のメインヒーローのみがプレイ可能です。
10の主な悪役はアーケードモードで再生可能ですが、他のすべてのゲームプレイモードでアクセスするためにロック解除する必要があります。
神の宇宙とカオスは、「世界B」との永遠の対立に閉じ込められています。
最初のファンタジーが行われる「世界A」の領域の鏡の寸法、
メインシリーズから他の世界からのいくつかの戦士を召喚して、バランスがカオスを支持して傾けるまで、終わりのない死と再生のサイクルで戦います。
このゲームは、主人公と敵対者の両方をFinal Dissidia for Fantasyの分割払いから団結させます。
彼らの物語は、2番目のゲームのルファインのCIDによって語られました。
戦争が終わりに近づいているように見えるので、コスモスの10人の戦士が一緒になって、カオスの手下に戻り、バランスを取り戻します。
前のサイクルで彼女の力の多くを失ったコスモスは、彼女に10人の戦士を光、ファイリオン、タマネギ騎士、セシル、バーツ、テラ、クラウド、スコール、ジダン、ジダンに与えます
ティダス - カオスを倒すのに役立つ10の結晶を取得するタスク。
彼らはそれぞれ「Destiny Odyssey」と呼ばれる旅に出発しました。そこでは、それぞれの物語が語られ、互いに協力しています。
彼らの「Destiny Odysseys」の間、ヒーローは彼らの個人的な悪役に遭遇します、
彼らが彼らの結晶を得るのを助けるのに役立つ自分自身についてのエピファニーを通して彼らを倒す。
「Destiny Odysseys」に続くのは「日陰の衝動」であり、10人の戦士がすべてのクリスタルを所有しています。
しかし、カオスに殺されたコスモスを救うには遅すぎます。
ヒーローは消え始めますが、結晶の力によって救われます、
彼らが残した時間を使って悪役に反撃し、カオスを完全に倒すことができるようにします。
最終的に、他の戦士たちは世界を自分の世界のために去り、戦士の光は別の冒険に乗り出します、
オリジナルのファンタジーのイベントをセットアップし、コスモスは世界Bを支配するために復活します